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期刊论文 6

年份

2021 1

2019 1

2014 3

2013 1

关键词

牙鲆 3

SNP芯片 1

乡村发展战略 1

乡村建设 1

乡村治理 1

乡村规划 1

单核苷酸多态性 1

双单倍体 1

基因组选择 1

性腺 1

抗病性 1

日本乡村 1

纯合度 1

近交系 1

连续三代雌核发育 1

退化 1

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Susceptibility of male and female Japanese medaka (

Nannan LIU, Mei MA, Yiping XU, Jinmiao ZHA, Kaifeng RAO, Zijian WANG

《环境科学与工程前沿(英文)》 2013年 第7卷 第1期   页码 77-84 doi: 10.1007/s11783-012-0466-z

摘要: 2,4,6-trichlorophenol (2,4,6-TCP) is a widespread probable human carcinogen and has been proven to have genotoxicity in assays. However, little genotoxicity information and no micronuclei induction data for 2,4,6-TCP is available from tests, especially for sex-specific differences. Following a preliminary test, a piscine peripheral erythrocyte micronucleus assay was conducted on medaka ( ) after a 28-day exposure to 2,4,6-TCP. In the present study, the mean micronuclei (MNC) frequencies of all of the groups increased in a dose-dependent manner, which indicated the potential genotoxicity of 2,4,6-TCP. Moreover, males were found to be more susceptible compared with females after a 28-day exposure to 2,4,6-TCP in all of the dosed groups above 10 μg·L . This is the first report on the potential of micronuclei induction and a sex-susceptible effect in the peripheral erythrocytes of mature fish after 2,4,6-TCP exposure.

关键词: 2     4     6-trichlorophenol     genotoxicity     Japanese medaka     piscine micronucleus test in peripheral erythrocytes     gender difference    

Transcriptome resources and genome-wide marker development for Japanese larch (

Wanfeng LI,Suying HAN,Liwang QI,Shougong ZHANG

《农业科学与工程前沿(英文)》 2014年 第1卷 第1期   页码 77-84 doi: 10.15302/J-FASE-2014010

摘要: While the differential responses of trees to changes in climatic and environmental conditions have been demonstrated as they age, the underlying mechanisms and age control of tree growth and development are complex and poorly understood particularly at a molecular level. In this paper, we present a transcriptome analysis of , a deciduous conifer that is widely-grown in the northern hemisphere and of significant ecological and economic value. Using high-throughput RNA sequencing, we obtained about 26 million reads from the stems of 1-, 2-, 5-, 10-, 25- and 50-year-old trees. Combining these with the published Roche 454 sequencing reads and the expressed sequence tags (both mainly from embryogenic cell cultures), we assembled 26670549 reads into 146786 transcripts, of which we annotated 79182 to support investigations of the molecular basis of tree aging and adaption, somatic embryogenesis and wood formation. Using these sequences we also identified many single-nucleotide polymorphisms, simple sequence repeats, and insertion and deletion markers to assist breeding and genetic diversity studies of .

关键词: Larix     transcriptome     age     wood formation     somatic embryogenesis     molecular marker    

日本乡村规划建设治理研究

冯旭,王凯,马克尼

《中国工程科学》 2019年 第21卷 第2期   页码 34-39 doi: 10.15302/J-SSCAE-2019.02.016

摘要:

本文对日本新版国土形成规划中的乡村定位,以及典型地区的乡村规划思路、建设内容、基层治理等进行了深入研究。日本乡村地区的规划与治理是在地方政府及村民自治会共同引导下,通过挖掘、发扬地域特色,实现对传统文化的保护、特色产业的振兴、乡村规划的编制、建设行为的管治。在未来乡村发展战略及建设重点、乡村规划编制目标与具体内容、乡村基层治理分工三个方面,对我国乡村规划建设与管理具有借鉴意义。

关键词: 乡村发展战略     乡村规划     乡村建设     乡村治理     日本乡村    

双单倍体牙鲆的性腺发生、性别分化及早期发育的研究

王桂兴,朱以美,侯吉伦,张晓彦,王玉芬,孙朝徽,姜秀凤,刘海金

《中国工程科学》 2014年 第16卷 第9期   页码 33-41

摘要:

本文利用组织切片的方法研究了双单倍体牙鲆的性腺发生、性别分化及早期发育。结果显示:双单倍体牙鲆中除雌性外,还有雄性和未分化鱼出现,所占比例分别为56 %、38 %和6 %。双单倍体牙鲆雌性的性别分化晚于普通牙鲆。雌鱼至100 日龄,卵巢腔仍未闭合;110 日龄雌鱼的产卵板上存在大量向卵母过渡的卵原细胞,未见Ⅰ时相卵母细胞出现。双单倍体牙鲆雄鱼精巢的分化在时间上和普通牙鲆的基本相同。随着发育的进行,双单倍体牙鲆雌鱼的卵巢出现部分异常的卵母细胞以及卵巢退化现象;部分雄鱼的精巢也有退化现象出现。9~11 月龄,双单倍体牙鲆雄鱼的精巢发育到Ⅲ期,而普通牙鲆性腺在同期进入了Ⅳ期;11 月龄开始双单倍体牙鲆雄鱼精巢有退化的迹象;13~15 月龄,精巢退化成精小叶,其中只含有精原细胞,初级精母细胞消失不见,似Ⅱ期精巢。

关键词: 牙鲆     双单倍体     性腺     退化    

牙鲆连续三代减数分裂雌核发育家系的遗传特征分析

侯吉伦,李超,王桂兴,张晓彦,孙朝徽,王玉芬,姜秀凤,刘海金

《中国工程科学》 2014年 第16卷 第9期   页码 26-32

摘要:

通过对连续两代减数分裂雌核发育牙鲆(Paralichthys olivaceus)再度诱导减数分裂雌核发育,首次获得三个连续三代减数分裂雌核发育二倍体家系(Meio-G3-1,Meio-G3-2,Meio-G3-3)。选用重组率高、中、低的30 对微卫星引物,分析该三个家系的遗传构成。30 个微卫星位点在三个家系中扩增到的等位基因数分别为35、38、37,平均等位基因数为1.17、1.27、1.23,平均观测杂合度(Ho)分别为0.146 7、0.255 6、0.205 6,平均纯合度分别为0.853 3、0.744 4、0.794 4。三个家系内个体间的平均遗传相似度为0.991 3、0.991 8、0.983 8,母本与子代之间的平均遗传相似度为0.994 6、0.996 8、0.992 3,三个家系间的遗传相似度分别为0.971 7(Meio-G3-1 和Meio-G3-2)、0.981 0(Meio-G3-1 和Meio-G3-3)、0.971 4(Meio-G3-2 和Meio-G3-3)。结果表明,连续三代诱导雌核发育能进一步提高个体的纯合度、个体间以及家系间的平均遗传相似度,是快速建立鱼类近交系的良好方法。

关键词: 牙鲆     连续三代雌核发育     纯合度     近交系    

牙鲆50K SNP芯片的研制及其在抗病性状基因组选择中的应用 Article

周茜, 陈亚东, 卢昇, 刘洋, 徐文腾, 李仰真, 王磊, 王娜, 杨英明, 陈松林

《工程(英文)》 2021年 第7卷 第3期   页码 406-411 doi: 10.1016/j.eng.2020.06.017

摘要:

单核苷酸多态性(SNP)芯片是一种强大的基因分型工具,用于遗传学研究和基因组选择(GS)育种。牙鲆是许多国家重要的经济养殖比目鱼品种。然而,高效基因分型工具的缺乏,严重阻碍了牙鲆基因组育种的进程。在本文中,我们研发了一款牙鲆50K“鱼芯1号”SNP芯片,并将其应用于抗病基因组选择。利用Affymetrix Axiom基因分型技术,我们从1099个个体的全基因组重测序数据中获得了超过4220万个SNP,从中选择了在基因组中均匀分布的48 697个SNP,研制成“鱼芯1号”SNP芯片。利用168个牙鲆个体对“鱼芯1号”芯片的分型效果进行了评价,结果表明,检出率(call rate, CR)高于98%的SNP位点占74.7%,多态性SNP位点具有较好的等位基因分离效果,并且85%以上的SNP与基于全基因组重测序数据获得的SNP一致。为了验证“鱼芯1号”芯片在基因组选择方面的应用效果,利用候选群体的27个个体和参考群体的931个个体的基因分型数据,计算了抗迟缓爱德华氏菌病性状的基因组估计育种值(GEBV)。与传统的基于系谱的最佳线性无偏预测(ABLUP)相比,加权基因组最佳线性无偏预测(wGBLUP)的预测准确性提高了21.2%,说明“鱼芯1号”芯片在基因组选择中的应用效果良好。综上所述,本文研制的牙鲆50K“鱼芯1号”芯片,为高质量的基因分型提供了一个有效的工具,推动了基于基因组选择的牙鲆抗病良种选育进程。

关键词: 牙鲆     单核苷酸多态性     SNP芯片     抗病性     基因组选择    

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Susceptibility of male and female Japanese medaka (

Nannan LIU, Mei MA, Yiping XU, Jinmiao ZHA, Kaifeng RAO, Zijian WANG

期刊论文

Transcriptome resources and genome-wide marker development for Japanese larch (

Wanfeng LI,Suying HAN,Liwang QI,Shougong ZHANG

期刊论文

日本乡村规划建设治理研究

冯旭,王凯,马克尼

期刊论文

双单倍体牙鲆的性腺发生、性别分化及早期发育的研究

王桂兴,朱以美,侯吉伦,张晓彦,王玉芬,孙朝徽,姜秀凤,刘海金

期刊论文

牙鲆连续三代减数分裂雌核发育家系的遗传特征分析

侯吉伦,李超,王桂兴,张晓彦,孙朝徽,王玉芬,姜秀凤,刘海金

期刊论文

牙鲆50K SNP芯片的研制及其在抗病性状基因组选择中的应用

周茜, 陈亚东, 卢昇, 刘洋, 徐文腾, 李仰真, 王磊, 王娜, 杨英明, 陈松林

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